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非经肠道全细胞霍乱疫苗的副作用与全细胞伤寒疫苗的副作用相比尽管不那么严重，但大致相似。大约50%的疫苗接种者在接种部位产生疼痛和发炎，10%-30%产生发烧和不适的全身症状。这些症状通常持续1-3天，尽管一些个体的症状延迟发生并在第4和第7天之间发生臂痛现象。
报告有疫苗接种后轻度的胃肠道症状，在对口服bs/wcv反应基因的随机、无效对照剂对照、双盲试验中这种症状的发生频率对于疫苗接受者和安慰剂接受者来说相同，使用建议的间隔两周注射两份疫苗的免疫计划的口服bs/w
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